EHEC: Scientists publish in PLoS ONE their prospective genomic characterization

(29.07.2011) Scientists of the Medical Faculty of the University Münster and the University Hospital Münster in collaboration with scientists of the enterprise `Life Technologies Corporation´ were the first to release a draft genome sequence of a German enterohemorrhagic E. coli (EHEC) 2011 outbreak strain on June 3rd. Their in-depth genomic characterization of this outbreak was published on July 20th in the online open access journal PLoS ONE.

Microbiologist Prof. Dr. Dag Harmsen from the Department of Periodontology in Münster – the corresponding author of this publication - is leading a team responsible for sequencing and conducting the bioinformatics analysis in Münster. "Thanks to the Ion Torrent PGM™ next generation sequencing (NGS) platform we were very quick.

In essence this is the first demonstration where NGS was used in real-time for genomic outbreak analysis. There have already been some publications using NGS to retrospectively analyze outbreaks, but analysis during an ongoing outbreak had not yet been performed (figure).

Basically a new discipline is born, i.e. prospective genomics epidemiology," he explains.

Such rapid sequencing is to be considered a "technical masterpiece, which will have immediate impact on surveillance and diagnostics and most probably in the future also on therapeutics", says Prof. Dr. Wilhelm Schmitz, Dean of the Medical Faculty of the University Münster.

"By comparing the EHEC O104:H4 outbreak genome with a simultaneously sequenced genome of an EHEC O104:H4 isolate from an HUS patient (isolated in Germany in 2001; the HUSEC041 reference strain), we were able to demonstrate that the current outbreak strain was not– as initially suggested - derived from the very similar enteroaggregative E. coli (EAEC) O104:H4 55989 strain but from a yet unknown Shiga toxin-producing O104:H4 progenitor strain", said Dr. Alexander Mellmann of the `National Consulting Laboratory for Hemolytic Uremic Syndrome (HUS) at the Institute of Hygiene, Münster.

The senior author of the PLoS ONE study and head of the Institute of Hygiene, Prof. Dr. h.c. Helge Karch, added, “This study underlined the great importance of the long-term storage of historical HUS isolates that were collected by us since 1996 to understand the evolution of highly-pathogenic EHEC strains.”

Citation:

Mellmann A*, Harmsen D*, Cummings CA*, Zentz EB, Leopold SR, et al. (2011) Prospective Genomic Characterization of the German Enterohemorrhagic Escherichia coli O104:H4 Outbreak by Rapid Next Generation Sequencing Technology. PLoS ONE 6(7): e22751. doi:10.1371/journal.pone.0022751

Mai multe Ştiri

Hills

Webinar Hill's - Nutriția în cazurile de Dermatită atopică la câine

Un câine cu mâncărimi este o problemă frecventă a clienților și poate reprezenta o provocare pentru medicii veterinari. Dermatita atopică a câinelui (DAC) este o dermatoză inflamatorie pruriginoasă, cronică și recidivantă, care necesită adesea un management pe tot parcursul vieții și este o sursă de frustrare atât pentru medicul veterinar, cât și pentru familie.
Citește mai mult

Logo CMVRO

Recomandări adresate medicilor veterinari pentru evitarea contaminării cu COVID-19

În contextul pandemiei de COVID-19, Colegiul Medicilor Veterinari din Romania vine cu o serie de recomandări la adresa medicilor veterinari pentru evitarea contaminării.
Citește mai mult

Program workshop

Protocoale de lucru și monitorizare în anestezia inhalatorie

În intervalul 28-29 martie 2020, Maravet împreună cu Facultatea de Medicină Veterinară și Farmacie din Cluj-Napoca vă invită la un workshop în domeniul anesteziei veterinare, "Protocoale de lucru și monitorizare în anestezia inhalatorie.
Citește mai mult

Workshop Introducere în Oncologia Veterinară

Vineri, 13 martie 2020, vă așteptăm la modulul I al Workshop-ului „Introducere în oncologia veterinară”. Vă puteți înscrie accesând linkul https://rsvo.ro/introducere-in-oncologie-modulul-1/ sau contactând reprezentantul dvs. de vânzări de la Maravet.
Citește mai mult

Imagine predefinită

Teaser Überschrift

grwgwre  rgerg er gerg er
Citește mai mult

Congres Medicină Veterinară Alternativă Cluj-Napoca

În intervalul 6-7 martie 2020 vă așteptăm la primul Congres de Medicină Veterinară Alternativă din Romania. Evenimentul este organizat de Facultatea de Medicină Veterinară din cadrul Universității de Ştiinţe Agricole şi Medicină Veterinară Cluj-Napoca.
Mai multe informații despre programul evenimentului și modul de înscriere a participanților la adresa: https://fmv.usamvcluj.ro/index.php/anunturi.
Citește mai mult

Global Symposium 2019

Hill's Global Symposium 2019

Suntem bucuroși să vă anunțăm că Hill’s Global Symposium 2019 va avea loc în perioada 14-15 iulie! Va fi un eveniment extraordinar, în care se va discuta despre puterea microbiomului, comunicare, social media.
Citește mai mult

A apărut ediţia a II-a din Ghidul animalelor de companie

Maravet organizează anul acesta cea de-a IV-a ediție a Cupei pescarului veterinar

Suntem bucuroși să vă anunțăm că anul acesta vom organiza a IV-a ediție a „Cupei Pescarului Veterinar Maravet” la care vă așteptăm cu mare drag.
Citește mai mult

Ştiinţa

Companii

Internaţional

Literatură